マヌカハニーは民間薬として高く評価されるようになりました。他のはちみつにはない、抗菌効果があることが研究で明らかになったためです。

マヌカには重要なミネラルも含まれます。ポリネシアの人々は、何百年もの間、マヌカの木を医療に用いてきました。マヌカはちみつの抗菌力の強さには差がありますが、これは自然なことです。

またマヌカはちみつはチキソトロピー（揺変性：静止状態では粘度が高いが、揺すると粘度が下がり液体に近づく性質）です。

 民間薬としては、風邪予防・のどの痛みを和らげる・口内炎の炎症を抑える等として、ティースプーン一杯程度のマヌカを毎日召し上がる方が大勢おられます。お口の中でゆっくりと溶かしてください。

風邪の場合、レモン果汁やショウガと一緒に、温かい飲み物にしてお召し上がり下さい（ただしこの場合、37度以上のお湯は使わない方がよいでしょう）。

食品としては、トーストに塗る（バターやマーガリンは抜き）、シリアルやヨーグルトに混ぜる、サンドイッチ用スプレッドとして、またパンケーキやアイスクリームのトッピング等としておいしく召し上がれます。クラッカーやチーズ、フルーツジュースとの相性も抜群です。

医療品グレードのマヌカは、傷の手当て用として、医療機関で使用される機会が増えています。また自然派のスキンケア化粧品として、マヌカが求められています。はちみつをそのままお肌につけることもできますし、クリームやお化粧水として、オリーブオイル、精油、シアバターと混ぜて使うこともできます。

マヌカをはじめとするはちみつを健康増進のために摂取する場合、37度以上の熱を加えないで下さい（天然の巣内の温度は人間の体温に37度程度で、これを超える温度は、はちみつ中の健康増進効果をもつ成分を損なうおそれがあるため）。